Rencontres bioinformatiques Ifremer

Les Rencontres Bioinformatiques Ifremer sont organisées sur deux journées et elles sont l'occasion d'échanger sur les travaux scientifiques en lien avec la bioinformatique. 

Edition 2019

Date : 7 et 8 novembre 2019

Lieu : salle de réunion "Salle de séminaire", située au sous-sol du Bat 24,  Université de Montpellier / Campus Triolet (plan).

Programme :

  • jeudi 7/11 :
    • 13h30 : accueil
    • 14h à 14h30 : introduction par le service bioinformatique
    • 14h30-15h30 : "Applications 3C/Hi-C pour l’assemblage de (Méta)génomes", Martial Marbouty, CR CNRS UMR 3525, Département Génomes et Génétique, Institut Pasteur, Paris.
    • 15h30-15h50 : "Traitement de la diversité génétique par des approches de variant calling sur des datas de NGS", Jean Delmotte, UMR IHPE, Ifremer, Montpellier
    • 15h50-16h10 : "Minion, Flora, Pirates & Corsaires, A l'assaut du pangenome des microalgues !", Grégory Carrier et Clément Bellot, LPBA, IFREMER Nantes
    • 16h10-16h40 : pause
    • 16h40-17h20 : "Oxford Nanopore Sequencing data analyses and applications", Babett Guenther, UMR Marbec, Ifremer, Sète.
    • 17h20-18h : table ronde sur les usages de la technologie Nanopore à l'Ifremer
  • vendredi 8/11 :
    • 9h-9h40 : "Development of a flexible automated workflow for the reproducible and standardized processing of DNA metabarcoding data", Laure Quintric et Cyril Noël, SeBiMER, Ifremer Brest
    • 9h40-10h20 : "Bioinformatic analysis on OsHV-1 during an infection in Crassostrea gigas", Camille Pelletier, SG2M, Ifremer, La Tremblade
    • 10h20-10h50 : pause
    • 10h50-11h30 : "De l'utilité de bien gérer les données bioinformatiques", Laura Leroi, SeBiMER, Ifremer Brest
    • 11h30-12h30 : discussion libre, débat, table ronde
    • 12h30 : fin des journées

Edition 2018

La première édition a eu lieu sur le site IFREMER de Nantes les 12 et 13 novembre 2018.

Programme et diapositives des présentations