GT5 - Biotechnologies appliquées aux pathogènes

Développements d'outils issus des biotechnologies et dédiés à l'amélioration des connaissances sur les pathogènes des espèces de poissons ou de mollusques étudiées dans les GT3 et 4.

Les pathogènes étudiés sont : Photobacterium damselae piscicida (bactérie pathogène des poissons), les parasites du genre Bonamia et les virus OsHV-1 (tous deux pathogènes des mollusques et en particulier des huitres).

Ce groupe de tâches consiste à effectuer les actions suivantes :

  1. Analyse comparée des séquences - Analyses in silico des gènes et des regions d’intérêt chez les pathogènes étudiés (IFREMER et IFAPA).
  2. Développement d’outils d’analyses à partir des NGS pour l’identification des espèces de Bonamia (IFREMER).
  3. Développement d’outils d’analyses à partir des NGS pour une l’identification des variants d'OsHV-1 (IFREMER).
  4. Développement de vaccins oraux basés sur les nanotechnologies pour combattre le Photobacterium (IFAPA).