GT2 - Production de ressources génomiques en utilisant les NGS

L'objectif principal de cette tache est la production et l'assemblage de donnés de séquences pour les espèces étudiées dans Aquagenet.

Cette tache a pour objectif de produire des données de séquences (génomiques ou transcriptomes) pour les organismes suivants : soles (Solea spp); mollusques (huîtres, moules et palourdes) et pathogènes (virus: herpes virus; parasites: Bonamia ostreae et Bonamia exitiosa; Bactéries: Photobacterium damselae sous-espèce piscicida).
Les organismes auront pu être exposés à des challenges en fonction des attendus des taches 3 à 5.

La dernière action de cette tache est l'assemblage et l'annotation des séquences obtenues et la création de bases de données publiques qui seront hébergées par IFAPA.