Le portail web Galaxy

Le portail web Galaxy permet de charger des données génomiques sur Caparmor et propose un ensemble d'outils pour :

  • manipuler les fichiers de séquences,
  • assembler les données de séquençage,
  • annoter les gènes et protéines prédites (par recherche d'homologies, alignement de séquences ou construction d'arbres phylogénétiques).

A chaque outil correspond un formulaire permettant à l'utilisateur de configurer son programme (données d'entrée, paramètres).

La soumission du formulaire génère les lignes de commandes qui sont exécutées sur Caparmor. Les fichiers de résultats sont visualisables ou téléchargeables directement dans le portail.